中國首次獲得寨卡病毒全基因組序列 由賽默飛助力完成測定
2月22日，記者從解放軍軍事醫學科學院獲悉，春節期間，中國廣東省出現寨卡病毒輸入性感染病例后，該院微生物流行病研究所迅即啟動應急工作機制，與廣州市第八人民醫院、出入境檢驗檢疫系統相關單位密切合作，在獲得從委內瑞拉歸國患者臨床標本后，采用高通量測序技術，于2月21日直接從尿液中獲得病毒全基因組序列。
據專家介紹，這是中國首次獲得寨卡病毒全基因組序列，也是全球首次直接從患者尿液中獲得病毒全基因組。該病毒基因組全長10.8kb，系統進化分析表明，屬于亞洲世系，與巴西、蘇里南、波多黎各等美洲國家流行毒株同源性為99.7%；核苷酸序列比對發現20個突變位點，其中5個突變位點導致氨基酸改變。寨卡病毒全基因組序列的獲得，為病毒的溯源和進化提供了重要證據，可用于指導診斷試劑、疫苗和藥物的研發，使中國在全球寨卡疫情防控中占得先機。
寨卡(Zika)病毒屬于黃病毒屬黃病毒科，是一種主要由伊蚊傳播的蟲媒病毒。1947年首次在烏干達寨卡叢林中的恒河猴體內分離出該病毒，全長基因組序列在2007年被測出。寨卡病毒流行的地理分布、臨床表現與登革熱、基孔肯雅熱十分相近，且均為蚊蟲叮咬傳播，因此很容易造成誤診。
本次寨卡病毒全基因組序列測定是在賽默飛公司Ion Torrent測序平臺完成的， Ion Torrent測序平臺是革新性的半導體芯片測序技術平臺，通過密布于半導體芯片上的微反應孔和專有的大規模并行芯片感應器，采用獨特的氫離子檢測原理，使研究人員能夠在2至7小時內，獲取10Mb到2Gb以上的高[accuracy]度序列。Ion Torrent的化學測序原理簡單真實、無修飾的核苷酸、無激光器或光學檢測設備，適合多種測序通量的科學研究，在[much]短時間內獲得真實可靠的實驗結果。
Ion Torrent快速的測序技術為突發事件提供了有力保障，迅速地助力重大疫情的破譯和防控，下圖為近幾年Ion Torrent平臺破譯的疫情 。
